(Ambush) Le maître Jedi Yoda est en mission secrète pour établir un traité avec le roi du système stratégique de Toydaria lorsque le comte Dooku tend une embuscade à son vaisseau. Yoda et trois soldats clones doivent faire face à l'assassin de Dooku , Asajj Ventress , et à son imposante armée de droïdes, pour prouver que les Jedi sont assez forts pour protéger le roi et son peuple des forces de la guerre...
Provoquant la panique à travers la galaxie, une mystérieuse arme séparatiste dévastatrice terrorise la flotte de la République. Anakin et Ahsoka arrivent sur place pour sauver le maître Jedi Plo Koon et ses soldats clones à temps...épisode 3 : l'ombre du malveillant (Shadow of Malevolence)
Avec l'aide de sa padawan Ahsoka et du maître Jedi Plo Koon, Anakin utilise des nouveaux Y-Wing bombardiers à longue portée pour mener une attaque audacieuse sur le vaisseau de guerre du général Grievous , le Malevolence, et son arme destructrice...épisode 4 : Détruisez le Malveillant(Destroy Malevolence)
Padmé Amidala et C-3PO sont pris en otage par le général Grievous . Anakin et Obi-Wan doivent alors sauver la sénatrice et terminer la destruction du Malevolence...épisode 5 : Les Bleus (Rookies)
Seuls sur un poste avancé lointain, les commandants clones Rex et Cody doivent inspirer leurs nouveaux frères d'arme à croire en eux-mêmes pour empêcher l'invasion d'un commando droïde...épisode 6 : La Chute du Droïde(Downfall of a Droid)
R2-D2 est perdu pendant une bataille intense, et Anakin doit le trouver avant que les Séparatistes ne découvrent les secrets militaires Jedi enfermés dans sa mémoire...épisode 7 : Duel de Droïdes(Duel of the Droids)
Anakin, Ahsoka et le droïde de remplacement R3 embarquent dans une mission de sauvetage et de sabotage lorsqu'ils découvrent que R2-D2 est retenu dans un poste d'écoute secret du général Grievous ...épisode 8 : Jedi Bombad (Bombad Jedi)
Jar Jar Binks est un chevalier Jedi ? C'est que pensent les Séparatistes lorsque le héros comique Gungan et C-3PO se battent pour sauver Padmé Amidala prise en otage par le maléfique vice-roi Nute Gunray ...épisode 9 : La Cape des Ténèbres(Cloak of Darkness)
Ahsoka et la maître Jedi Luminara escortent le vice-roi Nute Gunray vers son procès, sans savoir que le comte Dooku a envoyé son apprentie Asajj Ventress pour libérer le prisonnier et éliminer les Jedi...épisode 10 : L'Antre de Grievous(Lair of Grievous)
Le général Grievous doit prouver qu'il est à la hauteur des Séparatistes lorsque le comte Dooku amène le Maître Jedi Kit Fisto et son ancien padawan, le Jedi Mon Calamari Nahdar Vebb, dans la sinistre enclave de Grievous ...épisode 11 : La Capture du comte Dooku(Dooku Captured)
Alors qu'ils essayaient de kidnapper le comte Dooku , Anakin et Obi-Wan découvrent que le Seigneur Sith a déjà été capturé par des pirates...épisode 12 : Le général Gungan(The Gungan General)
Alors qu'ils négocient la rançon du comte Dooku , Anakin et Obi-Wan sont fait prisonniers. Les Jedi et le Sith forment une alliance improblable, tous trois voulant s'échapper, et avec Jar Jar Binks comme seul espoir...épisode 13 : Le Crash(Jedi Crash)
Alors qu'Anakin est gravement blessé dans une bataille, la général Jedi Aayla Secura doit apprendre à Ahsoka la philosophie Jedi consistant à ne pas avoir d'attachement personnel, alors qu'ils bravent une planète hostile à la recherche d'aide médicale pour le chevalier Jedi...épisode 14 : Les Défenseurs de la Paix(Defenders of Peace)
Alors que les Jedi combattent une nouvelle arme séparatiste, les pacifistes Lurmen doivent décider s'ils se soumettent aux Séparatistes ou s'ils combattent avec Anakin, Ahsoka et Aayla Secura...épisode 15 : Intrusion (Trespass)
Alors qu'ils enquêtent sur la disparition d'une force de sécurité clone, Anakin et Obi-Wan sont pris au milieu d'un conflit grandissant entre les habitants à fourrure d'un monde de glace désolé et les représentants avides d'une lune proche...épisode 16 : L'Ennemi Caché(The Hidden Enemy)
Anakin et Obi-Wan découvrent la preuve qu'un traitre se trouve dans leurs rangs alors qu'ils essayent de mener les forces de la République pour libérer la planète Christophsis du siège Séparatiste...épisode 17 : Le Virus de l'Ombre Bleue(Blue Shadow Virus)
Padmé et Jar Jar sont capturés alors qu'ils cherchent un laboratoire d'armes biologiques séparatiste, obligeant Anakin, Obi-Wan et Ahsoka à essayer de libérer leurs amis et stopper la propagation d'un virus mortel...épisode 18 : Les Mystères des Mille Lunes(Mystery of a Thousand Moons)
Le virus mortel Blue Shadow s'est répandu, infectant Ahsoka, Padmé et de nombreux clones, ne laissant que 48 heures à Anakin et Obi-Wan pour trouver un antidote sur une mystérieuse planète dont personne n'est jamais revenu...épisode 19 : Tempête sur Ryloth(Storm Over Ryloth)
Ahsoka désobéit aux ordres d'Anakin et perd une grande partie de son escadron, incitant Anakin à donner une leçon à sa padawan sur le respect de l'autorité, et une opportunité de rédemption...épisode 20 : Les Innocents de Ryloth(Innocents of Ryloth)
Dans le but de saboter une puissante arme séparatiste, Obi-Wan et une petite équipe de clones entrent dans une ville occupée et découvrent que ses habitants sont utilisés comme boucliers humains...épisode 21 : Liberté sur Ryloth(Liberty on Ryloth)
Alors que ses troupes diminuent, Mace Windu doit convaincre le combattant de la liberté Twi'lek Cham Syndulla de l'aider à sauver la capitale de la destruction par les droïdes...épisode 22 : Prise d'Otage(Hostage Crisis)
Pour libérer le seigneur du crime Ziro le Hutt, des chasseurs de primes prennent le contrôle du Sénat et font des otages, sans qu'ils ne sachent que le chevalier Jedi Anakin Skywalker est toujours à l'intérieur...
